Roche cobas s 201 system Manuel utilisateur

Maintenance de la
base de données
2
Archive Management
Le système archive automatiquement les données aux intervalles et heures
spécifiés au cours de l'installation du système.
Les critères d'archivage des données (par exemple l'archivage de
l'ensemble des données datant de plus de 30 jours) sont également définis
lors de l'installation.
Les données peuvent être archivées manuellement à tout moment.
Préparation d'un DVD-R pour l'archivage
1
Utilisez un nouveau DVD-R et marquez-le en indiquant la date actuelle.
Utilisez impérativement un DVD-R. N'utilisez pas de DVD-RW.
Utilisez un DVD-R de bonne qualité pour limiter les erreurs de
lecture/écriture et pour permettre la lecture du disque sur
plusieurs lecteurs.
Marquez le disque à l'aide d'un marqueur sans solvant et conçu
pour le marquage des DVD. Les marqueurs contenant des solvants
risquent d'attaquer la couche protectrice des DVD.
2
Insérez le disque marqué dans le lecteur DVD-ROM.
Le disque doit être inséré dans le lecteur peu avant la
programmation de l'archivage, et retiré une fois l'archivage
terminé. Ne laissez pas le disque dans le lecteur lorsque l'appareil
n'est pas en marche. Ne stockez pas les DVD dans un
environnement de laboratoire.
3
Sélectionnez Format dans le menu qui s'affiche à l'écran. La boîte de
dialogue Format E: s’affiche (figure 2.1).
Figure 2.1
Boîte de dialogue Format E:
02/2007, version 1.0
2.1
4
Laissez le champ Volume Label vierge, puis cliquez sur Start. Une boîte de
message s'affiche et signale que les données existantes sur le DVD-R vont
être perdues.
L'étiquette de volume est affectée automatiquement au cours du
processus de formatage.
5
Répondez Yes lorsque l'ordinateur vous invite à continuer. Une barre de
progression indique l'avancement du formatage (figure 2.2).
Figure 2.2
Affichage de la progression du formatage du DVD
6
Une fois le processus de formatage terminé, une boîte de message s'affiche
indiquant que le formatage du DVD-R est terminé mais que le support
doit être rendu compatible avant que la lecture des données ne puisse
s'effectuer.
N'exécutez pas la procédure Make Compatible avant que l'écriture
sur le DVD-R de toutes les données ne soit effectuée. Une fois la
procédure Make Compatible terminée, aucune donnée
supplémentaire ne peut être enregistrée sur le DVD.
Figure 2.3
Notification de la fin du processus de formatage.
7
2.2
Répondez OK à l'invite. Le DVD-R est maintenant formaté et prêt à
l'utilisation.
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Initialisation de l'archivage manuel
Cliquez avec le bouton droit de la souris sur l'icône Archive Management
dans la barre des tâches de la station de travail du Data Manager puis
sélectionnez Perform Archiving now dans le menu contextuel qui s'affiche
à l'écran (figure 2.4).
Option : Perform Archiving now
Figure 2.4
Menu contextuel Archive Management
Icône Archive Management
L'icône Archive Management est actualisée pour indiquer que l'archivage
est en cours.
Il n'est pas nécessaire d'arrêter le système pour effectuer un
archivage.
Les enregistrements de données qui résident dans la base de
données PDM de Roche depuis une période de temps supérieure au
nombre de jours spécifié sont automatiquement archivés et purgés
du système.
Rendre compatible un DVD-R
Une fois l'archivage et la purge effectués, le disque doit être rendu
compatible de sorte que les données puissent être lues sur la plupart des
lecteurs de disque.
N'exécutez pas la procédure Make Compatible avant que l'écriture
sur le DVD-R de toutes les données ne soit effectuée. Une fois la
procédure Make Compatible terminée, aucune donnée
supplémentaire ne peut être enregistrée sur le DVD.
1
Insérez le disque dans le lecteur de DVD-ROM.
2
Sélectionnez Make Compatible dans le menu qui s'affiche, puis cliquez sur
Start.
Conservation du support d'archivage
Retirez le disque du lecteur et placez-le dans le boîtier prévu à cet effet.
Ne laissez pas le disque dans le lecteur lorsque l'appareil n'est pas
en marche. Suivez les intructions du fabricant du disque
concernant sa conservation. Ne conservez pas le DVD dans un
environnement de laboratoire.
Nous vous recommandons de copier le DVD afin de réduire le
risque de perte des données archivées. Le DVD peut être copié sur
un autre ordinateur.
02/2007, version 1.0
2.3
Archivage de l'historique de sauvegarde
Sélectionnez le rapport Audit Trail > Backup History List dans l'application
Report Manager pour consulter l'historique de sauvegarde (reportez-vous
à la page 1.39).
Chargement des données archivées dans une base de données temporaire
Les données archivées peuvent être récupérées, analysées et imprimées. Un
enregistrement archivé est récupéré en chargeant le disque d'archivage
et en effectuant une requête pour un donneur, un pool, un batch, un
contrôle, un puits de plaque ou une analyse de pooling spécifique.
Les données archivées sont analysées dans une base de données
temporaire. Elles ne sont pas restaurées dans une base de données
active
1
Cliquez sur le bouton Archive
dans la zone des boutons de
commandes généraux dans les autres applications PDM pour lancer
Archive Viewer.
Archive Viewer démarre. L'onglet Management > Query est sélectionné
par défaut (figure 2.5).
Figure 2.5
Application Archive Viewer : onglet Management > Query
2.4
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
2
Si les données archivées comprennent un ID de batch, un ID de tube S, un
ID de tube de donneur, un ID de contrôle ou un ID d'analyse particulier à
récupérer, saisissez l'ID dans le champ Identifier. Si les données
archivées au cours d'un intervalle de temps spécifique doivent être
récupérées, saisissez les dates de début et de fin dans les champs
Date range.
Cliquez sur Last Month ou sur Last Year pour récupérer les
données archivées créées pendant la période de temps indiquée. Si
nécessaire, cliquez sur Reset pour effacer les champs pour une
nouvelle saisie.
Si aucun numéro de code-barres ou intervalle de date n'est saisi,
toutes les archives créées sur le système sont répertoriées.
Si une archive étrangère est en cours de récupération (archive créée
sur un autre système), les entrées ne sont pas requises dans les
champs Identifier et Date Range.
3
Cliquez sur Next. Toutes les archives créées sur le système correspondant
aux critères de recherche saisis s'affichent dans la partie supérieure de
l'écran (figure 2.6).
Toutes les archives
Créées par le
système
Import History
Figure 2.6
Onglet View Loaded
Les archives précédemment chargées s'affichent en vert.
Les archives précédemment récupérées sont répertoriées dans la
section Import History de la fenêtre selon l'ordre de récupération.
02/2007, version 1.0
4
Cochez la case dans la colonne Mark pour charger une archive.
5
Utilisez le disque d'archivage correspondant à l'archive sélectionnée.
2.5
6
Chargez le disque d'archivage dans le lecteur DVD-ROM.
Le disque ne doit pas rester dans le lecteur plus de quelques heures.
7
Si les données archivées sur un autre système sont en cours de
récupération, cliquez sur Foreign Archive pour rechercher le fichier
d'archivage, sélectionnez-le, puis cliquez sur Open.
8
Cliquez sur Next. Les données archivées sont chargées dans la base de
données temporaire.
Le chargement des données archivées peut prendre quelques
minutes. Tout dépend de la quantité de données en cours de
chargement.
Affichage desdonnées chargées
1
Cliquez sur le bouton Archive
pour lancer Archive Viewer.
2
Accédez à l'onglet Management > Query puis chargez les données
d'archivage dans la base de données temporaire (voir Chargement des
données archivées dans une base de données temporaire page 2.4).
3
Sélectionnez l'onglet View > Query puis saisissez les critères de recherche
souhaités.
4
Sélectionnez le type d'ID (par exemple Controls ou Pools), puis cliquez sur
Next. L'onglet correspondant (par exemple Controls or Pools) s'affiche.
5
Cliquez sur Next ou sur Previous pour afficher un autre onglet (Batch,
Pools, Donor, Controls, Plate Well ou Run) des données archivées.
Les données pertinentes correspondant à l'onglet sélectionné
apparaissent dans la partie supérieure de l'écran. Par exemple, lorsque
l'onglet Pools Archive s'affiche, le statut de pipetage et de lecture des
tubes S, ainsi que les données de résultat correspondant au pool
s'affichent en haut de l'écran.
2.6
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Onglet Batch Archive
Batch Information
Informations sur
la piste de contrôle
Informations sur le pool
Informations
sur le contrôle
Figure 2.7
Onglet Batch Archive
Les informations affichées dans l'onglet Batch Archive sont résumées cidessous :
Champ
Description
Batch Information
Batch ID
ID de batch contenant l'élément sélectionné.
Batch Status
État du traitement pour le batch.
Run ID
ID du pipetage au cours duquel le batch a été
constitué.
Thermocycler ID
ID du thermocycleur de l'analyseur COBAS®
TaqMan® dans lequel le batch a été analysé.
02/2007, version 1.0
CAP Instrument ID
ID de l'appareil COBAS® AmpliPrep où le
batch a été préparé.
CTM Instrument ID
ID de l'analyseur COBAS® TaqMan® dans
lequel le batch a été analysé.
STAR S/N
ID du pipetteur Hamilton Microlab STAR
IVD/STARlet IVD dans lequel le batch a été
pipeté.
Batch Date
Date et heure auxquelles le batch a été pipeté.
2.7
Champ
Description
Informations sur la piste de contrôle
Audit Date
Date et heure auxquelles l’événement s’est
produit.
User Full Name
Nom de l'utilisateur
l'événement s'est produit.
Message Code
Code accompagnant le message de l'événement.
Description
Message qui s'est affiché pour l'événement.
Workstation
Identification et emplacement de la station de
travail sur laquelle l'événement s'est produit.
connecté
lorsque
Informations sur le pool
SK24 Pos
Position du pool sur le portoir SK24.
S-Tube ID
ID de clip code-barres du tube S contenant le
pool.
IC Result
Résultat du contrôle interne pour le pool.
Test Result
Résultat cible pour le pool.
Calculated Result
Résultat basé sur le résultat IC et le résultat de
test.
Final Result
Résultat basé sur le résultat calculé et la validité
du batch.
Informations sur le contrôle
2.8
SK24 Pos
Position du contrôle sur le portoir SK24.
Control ID
ID de code-barres du tube S contenant le
contrôle.
IC Result
Résultat du contrôle interne pour le contrôle.
Test Result
Résultat cible pour le contrôle.
Calculated Result
Résultat basé sur le résultat IC et le résultat de
test.
Final Result
Résultat basé sur le résultat calculé et la validité
du batch.
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Onglet Pools Archive
S-tube Information
Informations sur
la piste de contrôle
Batch Information
Pooling Run Information
Figure 2.8
Onglet Pools Archive
Les informations affichées dans l'onglet Pools Archive sont résumées cidessous :
Champ
Description
S-tube Information
02/2007, version 1.0
S-Tube ID
ID de clip code-barres du tube S contenant le
pool.
Assay
Test effectué sur le pool.
Volume
Volume de liquide pipeté dans le tube S.
Reading Status
État de lecture du code-barres pour le tube S.
Pipetting Status
État du pipetage pour le pool.
Final Result
Résultat basé sur le résultat calculé et la
validité du batch.
Calculated Result
Résultat basé sur le résultat IC et le résultat de
test.
IC Result
Résultat du contrôle interne pour le pool.
Test Result
Résultat cible pour le pool.
2.9
Champ
Description
Informations sur la piste de contrôle
Audit Date
Date et heure auxquelles l’événement s’est
produit.
User Full Name
Nom de l'utilisateur connecté
l'événement s'est produit.
Message Code
Code
accompagnant
l'événement.
Description
Message qui s'est affiché pour l'événement.
Workstation
Identification et emplacement de la station de
travail sur laquelle l'événement s'est produit.
le
lorsque
message
de
Batch Information
Batch ID
ID de batch contenant l'élément sélectionné.
Batch Status
État du traitement pour le batch.
CAP Instrument ID
ID de l'appareil COBAS® AmpliPrep où le
batch a été préparé.
CTM Instrument ID
ID de l'analyseur COBAS® TaqMan® dans
lequel le batch a été analysé.
Thermocycler ID
ID du thermocycleur de l'analyseur COBAS®
TaqMan® dans lequel le batch a été analysé.
Donor Tube ID
ID de code-barres des tubes de donneurs
individuels qui ont été inclus dans le pool.
Pooling Run Information
2.10
Run ID
ID du pipetage au cours duquel le batch a été
constitué.
Pooling Type
Type d'analyse du pipetage au cours duquel le
batch a été créé.
STAR S/N
ID du pipetteur Hamilton Microlab STAR
IVD/STARlet IVD dans lequel le batch a été
pipeté.
Pooling Operator
Nom de l'utilisateur connecté lorsque l'analyse
du pooling a été effectuée.
Create Date
Date et heure auxquelles le batch a été pipeté.
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Onglet Donor Archive
Donor Tube Information
Plate Well Information
Informations sur
la piste de contrôle
Informations sur
l'analyse de pooling
Informations sur le pool
Figure 2.9
Onglet Donor Archive
Les informations affichées dans l'onglet Donor Archive sont résumées
ci-dessous :
Champ
Description
Donor Tube Information
Donor Tube ID
ID de code-barres figurant sur le tube
contenant l'échantillon du donneur.
Assay
Test effectué sur l'échantillon du donneur.
Final Result
Résultat à signaler pour l'échantillon du
donneur.
Acceptance Operator
Nom de l'utilisateur connecté lorsque les
résultats du donneur ont été acceptés.
Plate Well Information
02/2007, version 1.0
Plate ID
ID de code-barres figurant sur la plaque
contenant une fraction d'aliquote de
l'échantillon de donneur.
Plate Type
Plaque de stockage.
Plate Well Pos
Puits de plaque (c'est-à-dire E6) contenant une
fraction aliquote de l'échantillon de donneur.
Pipetting Status
État du pipetage pour le puits de plaque.
2.11
Champ
Description
Informations sur la piste de contrôle
Audit Date
Date et heure auxquelles l’événement s’est
produit.
User Full Name
Nom de l'utilisateur connecté
l'événement s'est produit.
Message Code
Code
accompagnant
l'événement.
Description
Message qui s'est affiché pour l'événement.
Workstation
Identification et emplacement de la station de
travail sur laquelle l'événement s'est produit.
le
lorsque
message
de
Informations sur l'analyse de pooling
Run ID
ID du pipetage au cours duquel le batch a été
constitué.
Pooling Type
Type d'analyse du pipetage au cours duquel le
batch a été créé.
Appareil
ID du pipetteur Hamilton Microlab STAR
IVD/STARlet IVD dans lequel le batch a été
pipeté.
Create Date
Date et heure auxquelles le batch a été pipeté.
Pooling Operator
Nom de l'utilisateur connecté lorsque l'analyse
du pooling a été effectuée.
Informations sur le pool
2.12
S-Tube ID
ID du clip code-barres du tube S contenant
l'échantillon de donneur.
Final Result
Résultat de pool basé sur le résultat IC, le
résultat cible et la validité du lot.
Batch ID
ID de batch comprenant l'échantillon de
donneur.
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Onglet Controls Archive
Control Information
Informations sur
la piste de contrôle
S-tube Information
Figure 2.10
Onglet Controls Archive
Les informations affichées dans l'onglet Controls Archive sont résumées
ci-dessous :
Champ
Description
Control Information
Control ID
ID de code-barres figurant sur le tube de
contrôle.
Assay
NC (contrôle négatif) ou PC (contrôle positif)
de type de contrôle plus la substance à
analyser.
Reading Status
État de lecture du code-barres pour le tube de
contrôle.
Expiration Date
Date d'expiration de contrôle lue sur le codebarres de contrôle.
Batch ID
ID de batch comprenant le contrôle.
Lot Number
Numéro de lot de contrôle lu à partir du codebarres de contrôle.
Informations sur la piste de contrôle
Audit Date
02/2007, version 1.0
Date et heure auxquelles l’événement s’est
produit.
2.13
Champ
Description
User Full Name
Nom de l'utilisateur connecté
l'événement s'est produit.
Message Code
Code
accompagnant
l'événement.
Description
Message qui s'est affiché pour l'événement.
Workstation
Identification et emplacement de la station de
travail sur laquelle l'événement s'est produit.
le
lorsque
message
de
S-tube Information
2.14
S-Tube ID
ID du clip code-barres du tube S contenant
l'échantillon de contrôle.
Assay
Test effectué sur le pool.
Volume
Volume de liquide pipeté dans le tube S.
Reading Status
État de lecture du code-barres pour le tube S.
Pipetting Status
État du pipetage pour le pool.
Final Result
Résultat basé sur le résultat calculé et la
validité du batch.
Calculated Result
Résultat basé sur le résultat IC et le résultat de
test.
IC Result
Résultat du contrôle interne pour le pool.
Test Result
Résultat cible pour le pool.
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Onglet Plate Well Archive
Plate Well Information
Informations sur
la piste de contrôle
Informations sur
les tubes de donneurs
Informations sur
l'analyse de pooling
Figure 2.11
Onglet Plate Well Archive
Les informations affichées dans l'onglet Plate Well Archive sont
résumées ci-dessous :
Champ
Description
Plate Well Information
Plate ID
ID de code-barres figurant sur la plaque de
stockage contenant une fraction d'aliquote de
l'échantillon de donneur.
Plate Type
Plaque de stockage.
Donor Tube ID
ID de code-barres figurant sur le tube à partir
duquel le contenu du puits a été pipeté.
Pipetting Status
État du pipetage pour le puits de plaque.
Plate Well Pos
Puits (c'est-à-dire E6) contenant une fraction
aliquote de l'échantillon de donneur.
Informations sur la piste de contrôle
02/2007, version 1.0
Audit Date
Date et heure auxquelles l’événement s’est
produit.
User Full Name
Nom de l'utilisateur connecté
l'événement s'est produit.
lorsque
2.15
Champ
Description
Message Code
Code
accompagnant
l'événement.
Description
Message qui s'est affiché pour l'événement.
Workstation
Identification et emplacement de la station de
travail sur laquelle l'événement s'est produit.
le
message
de
Informations sur les tubes de donneurs
Donor Tube ID
ID de code-barres figurant sur le tube à partir
duquel le contenu du puits a été pipeté.
Informations sur l'analyse de pooling
2.16
Run ID
ID du pipetage au cours duquel le batch a été
constitué.
Pooling Type
Type d'analyse du pipetage au cours duquel le
batch a été créé.
Appareil
ID du pipetteur Hamilton Microlab STAR
IVD/STARlet IVD dans lequel le batch a été
pipeté.
Create Date
Date et heure auxquelles le batch a été pipeté.
Pooling Operator
Nom de l'utilisateur connecté lorsque l'analyse
du pooling a été effectuée.
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Onglet Run Archive
Pooling Run Information
Informations sur
la piste de contrôle
Informations sur
les plaques de stockage
Informations sur
les tubes de donneurs
Figure 2.12
Onglet Run Archive
Les informations affichées dans l'onglet Run Archive sont résumées cidessous :
Champ
Description
Pooling Run Information
Run ID
ID du pipetage au cours duquel le batch a été
constitué.
Pooling Type
Type d'analyse du pipetage au cours duquel le
batch a été créé.
Create Date
Date et heure auxquelles le batch a été pipeté.
Instrument
ID du pipetteur Hamilton Microlab STAR
IVD/STARlet IVD dans lequel le batch a été
pipeté.
Pooling Operator
Nom de l'utilisateur connecté lorsque l'analyse
du pooling a été effectuée.
Informations sur la piste de contrôle
02/2007, version 1.0
Audit Date
Date et heure auxquelles l’événement s’est
produit.
User Full Name
Nom de l'utilisateur connecté
l'événement s'est produit.
lorsque
2.17
Champ
Description
Message Code
Code
accompagnant
l'événement.
Description
Message qui s'est affiché pour l'événement.
Workstation
Identification et emplacement de la station de
travail sur laquelle l'événement s'est produit.
le
message
de
Informations sur les plaques de stockage
Plate ID
ID de code-barres figurant sur la plaque de
stockage contenant une fraction d'aliquote de
l'échantillon de donneur.
Plate Type
Plaque de stockage.
Donor Tube ID
ID de code-barres figurant sur le tube à partir
duquel le contenu du puits a été pipeté.
Pipetting Status
État du pipetage pour le puits de plaque.
Plate Well Pos
Puits (c'est-à-dire E6) contenant une fraction
aliquote de l'échantillon de donneur.
Informations sur les tubes de donneurs
Donor Tube ID
2.18
ID de code-barres des tubes de donneurs
individuels qui ont été inclus dans le pool.
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Suppression des données archivées depuis la base de données temporaire
1
Affichez l'onglet Management > View Loaded (Figure 2.13).
Colonne Mark
Bouton
Remove
Figure 2.13
Onglet View Loaded
02/2007, version 1.0
2
Cochez la case dans la colonne Mark pour supprimer une archive à
partir de la base de données temporaire.
3
Cliquez sur Remove.
2.19
Sauvegarde de la base de données
Le système sauvegarde automatiquement la base de données aux
intervalles et heures spécifiées lors de l'installation du système.
Au besoin, il est possible d'exécuter une sauvegarde manuelle à tout
moment.
Préparation de la sauvegarde
1
Vérifiez que le lecteur de bandes magnétiques est allumé.
N'éteignez jamais le lecteur de bandes magnétiques lorsqu'il
contient une bande.
2
Sélectionnez la bande de sauvegarde à utiliser puis insérez-la dans le
lecteur.
Les sauvegardes sont programmées de manière à ce qu'une bande
soit réutilisée tous les sept jours.
Initialisation d'une sauvegarde manuelle
Cliquez avec le bouton droit de la souris sur l'icône Archive Management
dans la barre des tâches de la station de travail du Data Manager puis
sélectionnez Perform Backup now dans le menu contextuel affiché
(figure 2.14).
Perform Backup now
Figure 2.14
Menu contextuel Archive Management
Icône Archive Management
L'icône Archive Management s'actualise pour indiquer que la sauvegarde
de la bande est en cours.
Il n'est pas nécessaire d'arrêter le système pour effectuer une
sauvegarde.
Une sauvegarde complète de la base de données est effectuée.
Stockage du support de sauvegarde
La bande est automatiquement éjectée à la fin de la sauvegarde
pour éviter un écrasement de la bande par inadvertance lors de la
prochaine sauvegarde.
Les bandes utilisées pour la sauvegarde doivent être stockées
conformément au mode d'emploi de votre installation.
2.20
02/2007, version 1.0
Maintenance de la base de données
Examen de l'historique de sauvegarde
Sélectionnez le rapport Audit Trail > Backup History List dans l'application
Report Manager pour consulter l'historique de sauvegarde et déterminer
l'état d'une tâche de sauvegarde (voir page 1.39).
Restauration de la base de données
Contactez votre représentant d'entretien Roche si une restauration de la
base de données est nécessaire.
Nettoyage du lecteur de bandes magnétiques
Le lecteur de bandes magnétiques détecte automatiquement lorsqu'un
nettoyage est nécessaire. Si le nettoyage est nécessaire, la DEL jaune de
droite située sur la face avant du lecteur de bandes s'allume.
N'effectuez pas de nettoyage du lecteur de bandes magnétiques sauf
si la DEL jaune est allumée de manière constante ou si le logiciel de
sauvegarde vous signale que le nettoyage du lecteur de bandes est
requis.
Insérez la cartouche SDLT CleaningTape dans le lecteur de bandes. Le
lecteur effectue le cycle de nettoyage puis éjecte la cartouche une fois le
nettoyage terminé.
Le nettoyage prend entre 1 (à la première utilisation de la
cartouche) et 4 minutes (à la 20ème utilisation de la cartouche). Au
cours du cycle de nettoyage, la DEL jaune reste allumée et la DEL
verte centrale clignote.
Une cartouche de nettoyage peut être utilisée 20 fois maximum. Si
la cartouche n'est plus valable, le nettoyage n'a pas lieu et la DEL
jaune reste allumée.
02/2007, version 1.0
2.21
Cette page est intentionnellement laissée vierge.
2.22
02/2007, version 1.0