Composants du produit. illumina MiSeqDx MD

Vous trouverez ci-dessous de brèves informations sur l'instrument MiSeqDx MiSeqDx. C'est un instrument de séquençage qui mesure les signaux de fluorescence des nucléotides marqués. La plateforme MiSeqDx est destinée au séquençage ciblé d’ADN génomique humain provenant d’échantillons de sang total périphérique et conçu pour le diagnostic in vitro.

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Instrument MiSeqDx

7 Comme avec n’importe quel flux de travail à base d’hybridation, les polymorphismes, les mutations, les insertions ou les délétions sous-jacents dans les régions de liaison d’un oligonucléotide peuvent influer sur les allèles sondés et, par conséquent, les appels réalisés.

8 La couverture minimale recommandée par amplicon nécessaire pour un appel de variants précis (Q(max_gt | poly_site) >= 100) est de 75 ×.

Composants du produit

Le Illumina MiSeqDx comprend les composants suivants :

• Instrument MiSeqDx (N° de référence DX-410-1001)

Les composants logiciels suivants sont nécessaires au fonctionnement et à l’analyse des données sur MiSeqDx :°

Application logicielle

MOS : logiciel d’exploitation

MiSeqDx

RTA : logiciel d’analyse en temps réel

MiSeq

Reporter

Fonction

Commande le fonctionnement de l’instrument.

Effectue l’analyse primaire.

Effectue l’analyse secondaire.

Description

L’application logicielle MOS gère le fonctionnement de l’instrument au cours du séquençage et génère des images utilisées par le logiciel d’analyse en temps réel (RTA).

L’application logicielle RTA convertit les images générées par MOS pour chaque plaque par cycle de l’analyse de séquençage dans les fichiers de définition des bases qui constituent des entrées pour le logiciel MiSeq

Reporter. L’application logicielle RTA ne contient pas d’interface utilisateur.

Le logiciel MiSeq Reporter traite les définitions de bases par le biais d’une analyse secondaire qui inclut le démultiplexage, la génération de fichiers FASTQ, l’alignement, l’appel des variants et la génération de fichiers

VCF contenant des renseignements sur les variants trouvés à des positions spécifiques dans un génome de référence.

Stockage et manipulation

Élément

Température

Humidité

Caractéristique

Transport et stockage : de -10 °C à 40 °C (de 14 °F à 104 °F)

Conditions d’utilisation : de 19 °C à 25 °C (de 66 °F à 77 °F)

Transport et stockage : humidité sans condensation

Conditions d’utilisation : de 30 % à 75 % d’humidité relative (sans condensation)

Équipement et matériel nécessaires, non fournis

Consommables pour le séquençage

Trousse universelle MiSeqDx 1.0 (Nº de référence DX-103-1001)

Consommables fournis par l’utilisateur

Vérifiez la disponibilité des consommables suivants, fournis par l’utilisateur, avant de commencer une analyse.

Consommable

Lingettes alcoolisées, isopropyle à 70 % ou d’éthanol à 70 %

Tissu de laboratoire peu pelucheux

Papier optique, 4 x 6 po

Utilisation

Nettoyage du portoir de Flow Cell

Nettoyage de la platine de Flow Cell

Nettoyage de la Flow Cell

| nº 15070068 Rév. A FRA

Mars 2015

Fonctionnalités clés

Séquençage ciblé d’ADN génomique humain
Mesure des signaux de fluorescence des nucléotides marqués
Utilisation avec des tests de diagnostic in vitro et des trousses de réactifs Illumina
Analyse des données avec logiciel d’analyse en temps réel
Démultiplexage, génération de fichiers FASTQ, alignement, appel des variants, génération de fichiers VCF

Foire aux questions

L'instrument MiSeqDx est un instrument de séquençage qui mesure les signaux de fluorescence des nucléotides marqués pour le séquençage ciblé d’ADN génomique humain.

MiSeqDx est destiné à être utilisé avec des tests de diagnostic in vitro et des trousses de réactifs fournis par Illumina.

Le logiciel MiSeq Reporter traite les définitions de bases par le biais d'une analyse secondaire qui inclut le démultiplexage, la génération de fichiers FASTQ, l'alignement, l'appel des variants et la génération de fichiers VCF.