Composants du produit. illumina MiSeqDx MD

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Instrument MiSeqDx

7 Comme avec n’importe quel flux de travail à base d’hybridation, les polymorphismes, les mutations, les insertions ou les délétions sous-jacents dans les régions de liaison d’un oligonucléotide peuvent influer sur les allèles sondés et, par conséquent, les appels réalisés.

8 La couverture minimale recommandée par amplicon nécessaire pour un appel de variants précis (Q(max_gt | poly_site) >= 100) est de 75 ×.

Composants du produit

Le Illumina MiSeqDx comprend les composants suivants :

• Instrument MiSeqDx (N° de référence DX-410-1001)

Les composants logiciels suivants sont nécessaires au fonctionnement et à l’analyse des données sur MiSeqDx :°

Application logicielle

MOS : logiciel d’exploitation

MiSeqDx

RTA : logiciel d’analyse en temps réel

MiSeq

Reporter

Fonction

Commande le fonctionnement de l’instrument.

Effectue l’analyse primaire.

Effectue l’analyse secondaire.

Description

L’application logicielle MOS gère le fonctionnement de l’instrument au cours du séquençage et génère des images utilisées par le logiciel d’analyse en temps réel (RTA).

L’application logicielle RTA convertit les images générées par MOS pour chaque plaque par cycle de l’analyse de séquençage dans les fichiers de définition des bases qui constituent des entrées pour le logiciel MiSeq

Reporter. L’application logicielle RTA ne contient pas d’interface utilisateur.

Le logiciel MiSeq Reporter traite les définitions de bases par le biais d’une analyse secondaire qui inclut le démultiplexage, la génération de fichiers FASTQ, l’alignement, l’appel des variants et la génération de fichiers

VCF contenant des renseignements sur les variants trouvés à des positions spécifiques dans un génome de référence.