Instrument MiSeqDx
7 Comme avec n’importe quel flux de travail à base d’hybridation, les polymorphismes, les mutations, les insertions ou les délétions sous-jacents dans les régions de liaison d’un oligonucléotide peuvent influer sur les allèles sondés et, par conséquent, les appels réalisés.
8 La couverture minimale recommandée par amplicon nécessaire pour un appel de variants précis (Q(max_gt | poly_site) >= 100) est de 75 ×.
Composants du produit
Le Illumina MiSeqDx comprend les composants suivants :
• Instrument MiSeqDx (N° de référence DX-410-1001)
Les composants logiciels suivants sont nécessaires au fonctionnement et à l’analyse des données sur MiSeqDx :°
Application logicielle
MOS : logiciel d’exploitation
MiSeqDx
RTA : logiciel d’analyse en temps réel
MiSeq
Reporter
Fonction
Commande le fonctionnement de l’instrument.
Effectue l’analyse primaire.
Effectue l’analyse secondaire.
Description
L’application logicielle MOS gère le fonctionnement de l’instrument au cours du séquençage et génère des images utilisées par le logiciel d’analyse en temps réel (RTA).
L’application logicielle RTA convertit les images générées par MOS pour chaque plaque par cycle de l’analyse de séquençage dans les fichiers de définition des bases qui constituent des entrées pour le logiciel MiSeq
Reporter. L’application logicielle RTA ne contient pas d’interface utilisateur.
Le logiciel MiSeq Reporter traite les définitions de bases par le biais d’une analyse secondaire qui inclut le démultiplexage, la génération de fichiers FASTQ, l’alignement, l’appel des variants et la génération de fichiers
VCF contenant des renseignements sur les variants trouvés à des positions spécifiques dans un génome de référence.
Stockage et manipulation
Élément
Température
Humidité
Caractéristique
Transport et stockage : de -10 °C à 40 °C (de 14 °F à 104 °F)
Conditions d’utilisation : de 19 °C à 25 °C (de 66 °F à 77 °F)
Transport et stockage : humidité sans condensation
Conditions d’utilisation : de 30 % à 75 % d’humidité relative (sans condensation)
Équipement et matériel nécessaires, non fournis
Consommables pour le séquençage
Trousse universelle MiSeqDx 1.0 (Nº de référence DX-103-1001)
Consommables fournis par l’utilisateur
Vérifiez la disponibilité des consommables suivants, fournis par l’utilisateur, avant de commencer une analyse.
Consommable
Lingettes alcoolisées, isopropyle à 70 % ou d’éthanol à 70 %
Tissu de laboratoire peu pelucheux
Papier optique, 4 x 6 po
Utilisation
Nettoyage du portoir de Flow Cell
Nettoyage de la platine de Flow Cell
Nettoyage de la Flow Cell
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| nº 15070068 Rév. A FRA
Mars 2015
