Modifier des protocoles
Utilisez la fonction de modification des protocoles pour modifier les protocoles selon vos besoins. Par exemple, vous pouvez répéter les étapes d’un protocole ou modifier le nombre de cycles d’amplification dans la section Chemistry (Chimie).
Chaque protocole comprend deux sections principales :
} La section Chemistry (Chimie) : elle contient les instructions sur le pompage des réactifs, les modifications des températures et les durées d’attente. Cette section apparaît dans la partie supérieure de l’écran Protocol Editor (Modification des protocoles).
}
La section Protocol (Protocole) : elle contient une série d’étapes constituées de définitions chimiques. Cette section apparaît dans la partie inférieure de l’écran
Protocol Editor (Modification des protocoles).
Si vous modifiez un protocole existant, veillez à le renommer.
Protocol Editor (Modification des protocoles)
1 À partir de l’écran Start (Démarrer), sélectionnez Menu (Menu), puis Protocol Editor
(Modification des protocoles).
2 À partir de Protocol Editor (Modification des protocoles), sélectionnez Menu (Menu), puis sélectionnez la commande appropriée :
}
Sélectionnez Open (Ouvrir) pour ouvrir un protocole existant.
} Sélectionnez Load from Library (Charger à partir de la librairie) pour charger une définition chimique existante ou une étape du protocole stockée dans la librairie cBot.
}
Sélectionnez New Chemistry Definition (Nouvelle définition chimique) ou New
Protocol Step (Nouvelle étape du protocole) pour créer une nouvelle définition ou
étape et la stocker dans la librairie cBot.
3 Utilisez la flèche vers le bas située à gauche de l’étape pour développer les commandes de celle-ci. Utilisez la flèche du haut pour réduire les commandes.
4 Pour modifier une étape dans une définition chimique, mettez-la en surbrillance.
Les sélections permettant de modifier les commandes relatives à la pompe, à la rampe de température ou à l’attente apparaissent dans le panneau de droite.
5 Pour modifier une étape dans un protocole, mettez-la en surbrillance.
Les sélections permettant de modifier le nombre de cycles de la définition chimique sélectionnée apparaissent dans le panneau de droite.
6 Utilisez les icônes de Protocol Editor (Modification des protocoles) à droite du nom de l’étape pour réorganiser, supprimer ou copier des étapes et des commandes.
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Figure 29 Protocol Editor (Modification des protocoles), étapes développées
A Section Chemistry (Chimie)
B Section développée Chemistry (Chimie)
C Section Protocol (Protocole)
Icônes de Protocol Editor (Modification des protocoles)
Icône
Description
Déplace l’étape en surbrillance sous l’étape suivante du protocole.
Déplace l’étape en surbrillance au-dessus de l’étape précédente du protocole.
Supprime l’étape en surbrillance.
Répète l’étape en surbrillance.
Enregistre les modifications apportées à la librairie de protocoles.
Guide du système cBot
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Index
A aide
documentation 3
aide, technique 69
aluminium non percé 46
aluminium rouge, opercule 36
arrêt 56
assistance clientèle 69 assistance technique 69
C
capteurs 4
cBot plaques des réactifs 11
collecteur
peigne d’aspiration 4, 38 pince de sortie 38
collecteurs 37
commandes manuelles 49
compatibilité des versions
consommables 15 logiciel 15
composants 4
configuration 6-7
consommables
compatibilité des versions 15
déchargement 43
consommables fournis par l’utilisateur
préparation des réactifs 17
D
DECON 49
DECON à 5 % 49
décongélation de la plaque des
réactifs 22, 26
dénaturation 32
dénaturation de librairies 23, 27
dépannage
échec de la vérification du flux
ignorer la vérification du flux 59
dilution 32
distribution des réactifs, échec 46
documentation 3, 69
documents relatifs aux trousses 8
durée du lavage de maintenance 49
É
échec de la vérification du flux
dépannage 60
échecs de vérification du flux 62
E
erreurs de composants de l’analyse 40
erreurs de logiciel 62
état de veille 56
état du capteur, icônes 6
état du système 6
Guide du système cBot exigences d’analyse
configuration 7
F
fin d’une analyse 58
flacon à déchets 48
Flow Cell
emballage 21, 25
formules compatibles 15
nettoyage 21, 25
plaques d’adaptateur 51
positionnement 37 préparation du chargement 37
flux de travail
préparation 21, 25
formules
liste de 15
mise à niveau 55
H
HP10, préparation 29
I icônes
état du capteur 6
interruption d’une analyse 58
L lavage
plaques d’adaptateur 37
lavage après analyse 48 lavage avant analyse 48
lavage de l’instrument 45
lavages 34
fréquence 48
lecteur de code à barres
nettoyage 48
réinitialisation 63
librairies
chargement 38
concentration de chargement 23, 27 dénaturation 23, 27 dilution 23, 27
orientation de la barrette de tubes 39
logiciel
compatibilité des versions 15
mise à niveau 53
M
maintenance 45, 49, 56
entretien périodique 48 maintenance préventive 48
meilleures pratiques
préparation de réactifs 20
mélange principal ExAmp 28
messages d’erreur 62
67
68
mise hors tension 56 mode FSE 56
modèles
chargement 38
orientation de la barrette de tubes 39
modification des protocoles 64
N
NaOH 49
numéro de référence du réfrigérant 62
O
opercule en aluminium rouge 36
opercules non percé 46
P
PhiX
% de substance de contrôle 23, 27 ajout 23, 27
plage de température 62
plaque des réactifs 5
configurations 11
décongélation 22, 26, 29-30
préparation 23, 28
plaque des réactifs, débit élevé
préparation 29
plaque des réactifs, rapid
préparation 30
plaques d’adaptateur 51
lavage 37
plaques des réactifs
positionnement 36
platine des réactifs 5
platine thermique 4
lavage 45
positionnement des Flow Cell 37
préparation de réactifs
meilleures pratiques 20
préventive, maintenance 48
primers
chargement 39 nom, saisie 39 orientation de la barrette de tubes 39 personnaliser 39
problèmes de collecteur 62 problèmes de réfrigérant 62
procédures après analyse 43
Protocol Editor (Modification des protocoles)
icônes 65
protocole
sélection 35
protocoles de chimie 64 protocoles, modification 64
R
rapport sur les données de l’analyse 42
réactifs de génération d’amplifiats
préparation 20
réactifs ExAmp
à propos 21, 25
décongélation 22, 26
préparation 28
préparation, quatre Flow Cells 24 préparation, une Flow Cell 24
réactifs, préparation
débit élevé 29
Flow Cell GAIIx 20
Flow Cell HiSeq X 21
HiSeq 3000/4000 25
rapid 30
réaction ExAmp
préparation, quatre Flow Cells 24 préparation, une Flow Cell 24
réfrigérant
niveau 48
reprise d’une analyse 58
réservoir de lavage 34
résumé d’analyse 42
retrait des barrettes de huit tubes 46
S
sels, élimination 45
stockage de la Flow Cell 37, 43 stocker des Flow Cell 43
substitut DECON 49
T
température hors plage 62
V vérification avant analyse
erreurs 40 réalisation 40
vérification du flux analyse
démarrage 40
dépannage d’un échec 59
volumes distribués 46
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Courriel
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Région Numéro de la personne-ressource
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0800.81102
400.635.9898
80882346
900.812168
0800.918363
0800.911850
800960230
1.800.812949
Région
Italie
Japon
Norvège
Nouvelle-Zélande
Pays-Bas
Royaume-Uni
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Suisse
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Autres pays
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0800.0223859
0800.917.0041
1.800.579.2745
020790181
0800.563118
00806651752
+44.1799.534000
Fiches signalétiques (SDS) : disponibles sur le site Web d’Illumina à l’adresse support.illumina.com/sds.html
.
Documentation produit : disponible au format PDF en téléchargement sur le site Web d’Illumina. Accédez au site support.illumina.com, sélectionnez un produit, puis sélectionnez Documentation & Literature (Documentation et littérature).
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