Charger des consommables
Le logiciel vous guide à travers les étapes de chargement de la plaque des réactifs du cBot, de la Flow Cell, du collecteur du cBot et des barrettes de huit tubes contenant les librairies préparées. Selon le protocole de génération d’amplifiats que vous avez choisi, le logiciel peut vous inviter à charger une barrette de huit tubes contenant des primers supplémentaires.
Charger la plaque des réactifs
1 Retirez le couvercle en plastique transparent de la plaque des réactifs cBot.
2 Sélectionnez Scan Reagent ID (Numériser l’identifiant de réactif) pour activer le lecteur de codes à barres.
3 Soulevez le couvercle de l’instrument par son coin supérieur droit.
4 [Pour les réactifs de TruSeq v3 et TruSeq v2] Retirez l’opercule en aluminium rouge : a Maintenez chaque extrémité de la barrette de tubes de la rangée 10 et retirez l’opercule en aluminium rouge de la barrette de huit tubes. Éliminez l’opercule comme il convient.
b Cochez la case à l’écran pour indiquer que l’opercule a été retiré.
5 Tirez le levier de la plaque des réactifs vers vous et disposez la plaque des réactifs sur la platine des réactifs :
}
Toutes les plaques de réactifs à l’exception des plaques HiSeq X et
HiSeq 3000/4000 : disposez la plaque de sorte que la rangée 1 se trouve directement derrière les supports des barrettes de tubes. Le coin biseauté de la plaque est positionné dans le coin avant droit.
}
Plaques de réactifs HiSeq X et HiSeq 3000/4000 : disposez la plaque de sorte que l’étiquette code à barres soit orientée vers l’arrière de l’instrument. Les coins biseautés de la plaque sont positionnés directement derrière les supports des barrettes de tubes.
Figure 12 Positionner la plaque des réactifs
6 Libérez le levier pour fixer la plaque des réactifs.
7 Cochez la case à l’écran pour indiquer que la plaque des réactifs est chargée, puis sélectionnez Next (Suivant).
Charger la Flow Cell
1 Soulevez la pince de Flow Cell.
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Ressource nº 20004794
Document nº 15006165 v02 FRA
2 Lavez la plaque d’adaptateur de la platine thermique avec une petite quantité d’eau désionisée et séchez-la à l’aide d’un tissu nettoyant non pelucheux.
3 Retirez la Flow Cell de son lieu de stockage :
} Toutes les Flow Cell, sauf HiSeq X et HiSeq 3000/4000 : retirez la Flow Cell du tube de stockage à l’aide d’une pince en plastique. Rincez la Flow Cell avec de l’eau désionisée et séchez-la doucement avec un chiffon pour nettoyage de lentilles.
Réservez le tube et le tampon pour un stockage ultérieur.
}
Flow Cell HiSeq X et HiSeq 3000/4000 : la Flow Cell modélisée est prête à l’emploi après préparation de la Flow Cell.
4 Sélectionnez Scan Flow Cell ID (Numériser l’identifiant de la Flow Cell) pour activer le lecteur de codes à barres.
5 Pour numériser l’identifiant de la Flow Cell, maintenez le tube ou l’emballage étiquetés de la Flow Cell à proximité du plateau du lecteur, le code à barres orienté vers l’instrument.
6 Positionnez la Flow Cell sur la platine thermique, les orifices du port de la Flow Cell vers le haut.
}
Flow Cell HiSeq et HiSeq X : la ligne 1 se situe du côté droit, près de l’angle sectionné.
}
Flow Cell GAIIx : la ligne 8 se situe du côté droit avec l’identifiant du code à barres.
7 Cochez la case pour indiquer que la Flow Cell est chargée, puis sélectionnez Next
(Suivant).
Charger le collecteur
Utilisez le collecteur fourni dans la même trousse d’amplifiats que la Flow Cell.
1 Inspectez les dispositifs d’aspiration du peigne d’aspiration pour déceler la présence de dommages. Assurez-vous que les joints en caoutchouc noir sont fixés uniformément.
2 Positionnez le collecteur au-dessus de la Flow Cell, le peigne d’aspiration orienté vers l’avant du cBot.
3 Alignez le collecteur et les broches de guidage sur la platine thermique, puis installez le collecteur sur la Flow Cell. Installez-le de manière uniforme pour que la jonction soit
étanche.
4 Cochez la case Manifold seated over flow cell (Collecteur placé au-dessus de la
Flow Cell).
5 Fermez la pince de Flow Cell pour maintenir le collecteur.
Figure 13 Fermer la pince de Flow Cell
6 Cochez la case Flow cell clamp closed (Pince de Flow Cell fermée).
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7 Connectez l’extrémité de sortie du collecteur au port de sortie du réservoir de lavage.
Assurez-vous que l’extrémité de sortie est connectée de manière uniforme.
Figure 14 Sécuriser l’extrémité de sortie
A Port de sortie
B Pince de sortie
8 Clipsez la pince de sortie afin de maintenir l’extrémité de sortie du collecteur en place.
9 Cochez la case Outlet clamp closed (Pince de sortie fermée).
10 Alignez le peigne d’aspiration et les deux broches de guidage métalliques à l’avant de la platine thermique.
Figure 15 Sécuriser le peigne d’aspiration
A Broches de guidage métalliques
B Onglets en plastique
11 Maintenez le peigne d’aspiration en place à l’aide des onglets en plastique situés de part et d’autre du peigne.
12 Veillez à ce que les dispositifs d’aspiration soient droits et perpendiculaires à la plaque des réactifs et à ce que la case Sipper comb in place (Peigne d’aspiration en place) soit cochée.
13 Cochez la case Sipper comb in place (Peigne d’aspiration en place), puis sélectionnez
Next (Suivant).
Charger les modèles
1 Sélectionnez Enter Template Name (Saisir le nom du modèle).
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2 À l’aide du clavier à l’écran, saisissez l’identifiant du modèle, puis appuyez sur la touche Enter (Entrée).
3 Chargez la barrette de huit tubes contenant les librairies préparées dans la rangée des modèles. Assurez-vous que l’ordre des tubes numérotés correspond à l’orientation des lignes de la Flow Cell.
} Flow Cell HiSeq et HiSeq X : les tubes sont numérotés de droite à gauche.
}
Flow Cell GAIIx : les tubes sont numérotés de gauche à droite.
HiSeq X, HiSeq 3000/4000,
HiSeq v4 et
TruSeq v3 (HiSeq)
HiSeq Rapid v2,
TruSeq Rapid (HiSeq)
TruSeq v2 (GAIIx)
4 Cochez la case pour indiquer que les modèles sont chargés.
5 Si vous utilisez des primers supplémentaires, passez à la section
Charger les primers
.
Dans le cas contraire, fermez le couvercle du cBot et sélectionnez Next (Suivant) pour accéder à la section
Effectuer une vérification avant analyse à la page 40
.
Charger les primers
L’écran Load Primers (Charger les primers) s’affiche pour les flux de travail autorisant des primers personnalisés ou nécessitant des primers supplémentaires. Pour séquencer des librairies Nextera sur une Flow Cell TruSeq v3 ou TruSeq v2, vous devez charger une barrette de huit tubes contenant du HP10.
1 Sélectionnez Enter Primer Name (Saisir le nom du primer).
2 À l’aide du clavier à l’écran, tapez le nom du primer, puis appuyez sur la touche Enter
(Entrée).
3 Chargez la barrette de huit tubes contenant les primers dans la rangée des primers.
Assurez-vous que l’ordre des tubes numérotés correspond à l’orientation des lignes de la Flow Cell :
}
Flow Cell HiSeq et HiSeq X : les tubes sont numérotés de droite à gauche.
} Flow Cell GAIIx : les tubes sont numérotés de gauche à droite.
HiSeq X, HiSeq 3000/4000,
HiSeq v4 et
TruSeq v3 (HiSeq)
HiSeq Rapid v2,
TruSeq Rapid (HiSeq)
TruSeq v2 (GAIIx)
4 Cochez la case pour indiquer que les primers sont chargés et fermez le couvercle de l’instrument.
5 Sélectionnez Next (Suivant).
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