Fichiers de sortie de séquençage
Type de fichier
Fichiers de définition des bases
Fichier index de définition des bases
Fichiers d’emplacement des amplifiats
Fichier de filtrage
Fichiers InterOp
Fichier de configuration
RTA
Fichier de renseignements sur l’analyse
Description des fichiers, emplacement et nom
Chaque plaque analysée est incluse dans un fichier de définition des bases; ces fichiers sont rassemblés dans un fichier pour chaque cycle.
Le fichier rassemblé contient la définition des bases ainsi que le score de qualité codé associé à chaque amplifiat.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
[Cycle].bcl.bgzf
, où [Cycle] représente le numéro à quatre chiffres du cycle. Les fichiers de définition des bases sont compressés à l’aide du logiciel de compression gzip.
Un fichier index binaire indique les renseignements sur la plaque d’origine dans une paire de valeurs pour chaque plaque, qui sont le numéro et le nombre d’amplifiats de la plaque.
Les fichiers index de définition des bases sont créés la première fois qu’un fichier de définition des bases est créé.
Data\Intensities\BaseCalls\L001 s_[Ligne].bci
Pour chaque plaque, les coordonnées XY de chaque amplifiat sont rassemblées dans un fichier d’emplacement des amplifiats. Les fichiers d’emplacement des amplifiats sont le résultat de la génération du modèle.
Data\Intensities\L001 s_[ligne].locs
Le fichier de filtrage indique si un amplifiat a franchi les filtres. Les renseignements de filtrage sont rassemblés dans un fichier de filtrage pour chaque lecture.
Les fichiers de filtrage sont générés au cycle 26 et portent sur 25 cycles de données.
Data\Intensities\BaseCalls\L001 s_[ligne].filter
Les fichiers binaires sont utilisés pour le logiciel Sequencing Analysis
Viewer. Les fichiers InterOp sont mis à jour tout au long de l’analyse.
Dossier InterOp
Créé au début de l’analyse, le fichier de configuration RTA indique les paramètres de l’analyse.
[Dossier racine] , RTAConfiguration.xml
Indique le nom de l’analyse, le nombre de cycles à chaque lecture, si la lecture est une lecture d’index et le nombre de témoins et de plaques sur la Flow Cell. Le fichier de renseignements sur l’analyse est créé au début de l’analyse.
[Dossier racine] , RunInfo.xml
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Support nº 20002370
Document nº 1000000002695 v00 FRA
