SUGGESTIONS PÉDAGOGIQUES
Comparer les séquences
Alignement avec discontinuité montrant les 51 premières bases des séquences des globines humaines alpha, bêta,
gamma et delta. Le signe - représente les identités, le signe _ les discontinuités.
Alignement multiple de séquences d'ADN :
-> 213 bases identiques (représentées par le signe *)
soit 47,3 % d'identité
Bêta
longueur : 444 bases (sans compter les discontinuités)
-> référence pour la comparaison
Delta
longueur : 444 bases (sans compter les discontinuités)
-> 411 bases identiques à la séquence de référence Bêta,
soit 92,6 % d'identité
Gamma
longueur : 444 bases (sans compter les discontinuités)
-> 339 bases identiques à la séquence de référence Bêta,
soit 76,4 % d'identité
Alpha
longueur : 429 bases (sans compter les discontinuités)
-> 264 bases identiques à la séquence de référence Bêta,
soit 61,5 % d'identité
Comme attendu, les similitudes constatées à propos des protéines se retrouvent au niveau des parties
codantes des gènes. Notons toutefois que de nombreuses différences au niveau des gènes ne se
traduisent pas par des différences entre les polypeptides, à cause du caractère dégénéré du code
génétique.
Le bilan de tout ce travail conduit à l'idée qu'il existe dans le génome humain des gènes apparentés car
présentant des ressemblances qui ne peuvent s'expliquer par des processus aléatoires. Il reste à
rechercher, ce qui ne peut être fait avec le logiciel :
• une explication à cette parenté (notion de duplication des gènes) ;
• une explication aux différences constatées entre ces gènes et à leur degré plus ou moins
important (mutations des gènes après leur duplication) ;
78
">
