Consommables et équipement fournis par l’utilisateur. illumina Covaris LE220, Caliper GX, Instrument HiSeq X, M, Hamilton Microlab STAR, Gemini XPS, HiSeq X Five, cBot, LightCycler 480, HiSeq X Ten

Documento

Consommables et équipement fournis par l’utilisateur

Les consommables et l’équipement suivants, fournis par l’utilisateur, sont utilisés pour la préparation de librairies, la génération d’amplifiats sur le cBot et le séquençage sur le

HiSeq X. Pour plus de renseignements, consultez le Guide du système HiSeq X (document

nº 15050091).

Consommables pour la préparation de librairies

Consommable

Plaques FLUOTRAC à

96 puits, noires

Plaques PCR à 96 puits

(HSP), à coque plastique rigide

Plaques PCR à 96 puits,

0,3 mL sans jupe, ou plaques PCR à 96 puits,

Twin.tec

Fournisseur

Fournisseur de laboratoire général

Greiner Bio-One, référence 655076

Fournisseur de laboratoire général

Bio-Rad, référence HSP-

9601

Fournisseur de laboratoire général

E&K Scientific, référence 480096

Eppendorf, référence 951020303

Thermo Scientific, référence AB-0800150

Usage mensuel

Variable

2 étuis (25 par

étui)¹

1 étui (25 par

étui)²

Plaques PCR à 96 puits

(TCY), 0,2 mL, collerette autour de chaque puits

Plaques de stockage à

96 puits (midi), puits rond de

0,8 mL

Thermo Scientific, référence AB-0859

Plaques de stockage à

96 puits (super midi), puits rond de 1,2 mL

Plaque PCR 384-C Axygen

Thermo Scientific, référence AB-0564

5 étuis (50 par

étui)¹

3 étuis (50 par

étui)²

5 étuis (50 par

étui)¹

3 étuis (50 par

étui)²

Variable

Flacon, 125 mL

Fournisseur de laboratoire général

VWR, référence 10011-

194

Fournisseur de laboratoire général

Trousse de réactifs d’ADN à haute sensibilité

PerkinElmer, référence CLS760672

Utilisation

Préparation des librairies :

ADN quantitatif sur

SpectraMax

Préparation des librairies : étapes de la

PCR

Préparation des librairies : étapes de la

PCR

Préparation automatisée des librairies : étapes de la PCR

Préparation des librairies

Préparation automatisée des librairies : étapes

PDP, quantification des librairies

Électrophorèse automatisée sur le

Caliper GX

Préparation automatisée des librairies : quantification de l’ADN

Préparation des librairies : contrôle qualité

Guide d’aménagement du laboratoire et de préparation du site du système HiSeq X

Consommable

Couvercles

Chiffon non pelucheux

Éthanol 200 (absolu) pour la biologie moléculaire

(500 mL)

Éthanol à 70 %

Fournisseur

Fournisseur de laboratoire général

Sigma-

Aldrich, référence E7023

Fournisseur de laboratoire général

Quantification fluorométrique avec réactifs de marquage des liaisons de l’ADN double brin

Opercule en aluminium

Fournisseur de laboratoire général

Covaris, référence 520073

Usage mensuel Utilisation

Préparation automatisée des librairies : stockage des plaques d’ADN

Préparation automatisée des librairies : maintenance ML STAR

Préparation automatisée des librairies

Préparation automatisée des librairies : maintenance ML STAR

Quantification des librairies

Puce à ADN LabChip HT de portée étendue

Trousse complète de quantification de librairie

KAPA (universelle)

ADN Lambda (λ)

PerkinElmer, référence 760517

KAPA Biosystems, référence KK4824

Life Technologies, référence 25250-010

Plaques multipuits (384 puits) pour LightCycler 480, blanches

Roche, référence 04729749001

Opercule en aluminium pour

LightCycler 480

Désinfectant Microside SQ à large spectre

Éprouvettes microTUBE, barrettes de huit tubes

(12 unités par paquet)

Scellés adhésifs

Microseal « B »

Roche, référence 04729757001

Hamilton, référence 3896-

Covaris, référence 520053

Bio-Rad, référence MSB-

1001

Variable

Préparation automatisée des librairies : coupe d’ADN avec Covaris

Préparation des librairies : contrôle qualité

Quantification des librairies

Préparation automatisée des librairies : quantification de l’ADN

Préparation des librairies : PCR sur le

LightCycler 480

Préparation automatisée des librairies : quantification des librairies

Préparation automatisée des librairies : ML STAR maintenance

Préparation des librairies : coupe d’ADN avec Covaris

Préparation des librairies

Document nº 15050093 v02 FRA

Consommable

Scellés adhésifs

Microseal « F »

Pipettes, canal unique, 20 µL Fournisseur de laboratoire général

Pipettes, canal unique, 200 µL Fournisseur de laboratoire général

Pipettes, canal unique,

1 000 µL

Embouts de pipettes, filtre protecteur, 10 µL

Fournisseur de laboratoire général

Embouts de pipettes, filtre protecteur, 20 µL

Embouts de pipettes, filtre protecteur, 200 µL

Embouts de pipettes, filtre protecteur, 1 000 µL

Embouts de pipettes,

Hamilton, avec filtre, stériles,

50 µL

Fournisseur de laboratoire général

Hamilton, référence 235979

Embouts de pipettes,

Hamilton, stériles, 300 µL

Hamilton, référence 235938

Réactifs d’ADN double brin

Quant-iT PicoGreen

Réservoirs de réactifs, multicanaux, jetables, sans

RNase et DNase

Châssis du réservoir

Demi-réservoirs, 75 mL

Réservoirs, 60 mL

Fournisseur

Bio-Rad, référence MSF-

1001

Usage mensuel

Variable

Utilisation

Préparation des librairies : apposition des scellés sur les plaques quantitatives et protection des marqueurs quantitatifs, apposition des scellés sur les plaques PCR

Préparation des librairies

400 boîtes¹

200 boîtes²

400 boîtes¹

200 boîtes²

Variable

Préparation des librairies

Préparation automatisée des librairies

Préparation automatisée des librairies : fractionnement des volumes de réactifs

Préparation automatisée des librairies : quantification de l’ADN

Préparation des librairies

Life Technologies, référence P11495

Fournisseur de laboratoire général

VWR, référence 89094-

658

Beckman Coulter, référence 372795

Beckman Coulter, référence 372786

Hamilton, référence 194051

Préparation automatisée des librairies : quantification de l’ADN

Préparation automatisée des librairies

Guide d’aménagement du laboratoire et de préparation du site du système HiSeq X

Consommable

Réservoirs à 96 puits

RNaseZap

Tampon TE, 1X, qualité biologie moléculaire

Tubes coniques, 15 mL

Tubes pour microcentrifugeuse, 1,7 mL

Tween 20

Eau désionisée

Eau pour PCR

Fournisseur

Seahorse Bioscience, référence 201246-100

Fournisseur de laboratoire général

Corning, nº de référence 430052

Fournisseur de laboratoire général

Sigma-Aldrich, référence P7949

Fournisseur de laboratoire général

Usage mensuel

Variable

Utilisation

Préparation automatisée des librairies

Décontamination des surfaces

Préparation automatisée des librairies : quantification de l’ADN

Utilisation générale

Variable

Utilisation générale

Préparation automatisée des librairies : maintenance ML STAR

Préparation automatisée des librairies : quantification des librairies

¹ HiSeq X Ten

² HiSeq X Five

Équipement de préparation de librairies

Source Élément

Thermocycleur à 96 puits (avec couvercle chauffé)

• Bio-Rad S1000

• Bio-Rad C1000

• Eppendorf Mastercycler pro S

Lecteur de codes à barres portable

Covaris LE220

Bio-Rad, référence S1000

Bio-Rad, référence C1000

Eppendorf, référence 6325

Motorola, référence DS4208

Covaris LE220 (communiquez avec Covaris)

Covaris, référence 500191 Support Covaris pour barrette de huit microTUBE (12)

Microcentrifugeuse de paillasse

LabChip GX Touch 24 pour génomique

Fournisseur de laboratoire général

PerkinElmer

Quantité

4¹

2²

1 (minimum)

2 (recommandé)

Document nº 15050093 v02 FRA

Élément

Hamilton Microlab STAR, laboratoire pré-

PCR et laboratoire post-PCR

Incubateur de microéchantillons Hybex

Bac à glaçons

LightCycler 480 Instrument II, système à

384 puits

Support magnétique à 96 puits

Source

Hamilton, référence 95300-01

SciGene, référence 1057-30-0

Fournisseur de laboratoire général

Roche, référence 05015243001

Quantité

2 (minimum)

4 (recommandé)

Blocs chauffants pré-PCR

Système chauffant SciGene

• 115 V

• 220 V

Modèles SpectraMax Gemini XPS ou série M

Life Technologies, référence AM10027

VWR, référence 13500-890

1 (minimum)

2 (recommandé)

1 (minimum)

2 (recommandé)

2 Agitateur pour microplaques à grande vitesse (peut agiter à 1 800 tr/min)

Rouleau Microseal

Mini-agitateur

MiniFuge

Centrifugeuse pour plaques

Fournisseur de laboratoire général

VWR, référence 58816-121

VWR, référence 93000-196

Fournisseur de laboratoire général

Illumina, référence BD-60-601

Illumina, référence SC-60-503

Molecular Devices, référence XPS

Molecular Devices, série M

1 (minimum)

2 (recommandé)

¹ HiSeq X Ten

² HiSeq X Five

Consommables de génération d’amplifiats et de séquençage

Consommable Fournisseur Utilisation

1 N NaOH Fournisseur de laboratoire général

Usage mensuel

Variable

Barrettes de huit tubes de

0,2 mL

Barrettes de huit bouchons, plates

Thermo Scientific, référence AB-

0264

Thermo Scientific, référence AB-

0784

Variable

Dénaturation des librairies avant la génération d’amplifiats

Génération d’amplifiats sur le cBot

Fermeture des barrettes de huit tubes lorsqu’elles ne sont pas utilisées

Guide d’aménagement du laboratoire et de préparation du site du système HiSeq X

Consommable

Réservoirs de 60 mL

Réservoirs à 96 puits

Bonbonne, au moins six litres

Éthanol à 70 % ou

Lingettes alcoolisées, isopropyle à 70 %

Éthanol 200 (absolu) pour la biologie moléculaire

Gants jetables non poudrés

Tissu de laboratoire peu pelucheux

Fournisseur

Hamilton, nº de référence 194051

Seahorse Bioscience, référence 201246-100-01

Fournisseur de laboratoire général,

Corning, référence 430776

Fournisseur de laboratoire général

VWR, référence 95041-714

Fournisseur de laboratoire général

Sigma-Aldrich, référence 7023

Usage mensuel

Variable

Utilisation

Préparation d’une barrette de huit tubes de modèle de librairie sur le

ML STAR

Préparation d’une barrette de huit tubes de librairies groupées sur le

ML STAR

Préparation de la solution de lavage de maintenance

Nettoyage de la

Flow Cell et de la platine de Flow Cell

Utilisation générale

Fournisseur de laboratoire général Variable

Fournisseur de laboratoire général

VWR, référence 21905-026

Variable

Papier pour lentilles,

10,1 x 15,2 cm (4 x 6 po)

Embouts de pipettes, filtre protecteur, 10 µL

Embouts de pipettes, filtre protecteur, 20 µL

Embouts de pipettes, filtre protecteur, 200 µL

Embouts de pipettes, filtre protecteur, 1 000 µL

Pipettes, multicanaux,

10 µL

Pipettes, multicanaux,

20 µL

Pipettes, multicanaux,

200 µL

Pipettes, multicanaux,

1 000 µL

Pipettes, canal unique,

10 µL

Fournisseur de laboratoire général

VWR, référence 52846-001

Fournisseur de laboratoire général

Variable

Utilisation générale

Nettoyage de la

Flow Cell et de la platine de Flow Cell

Nettoyage de la

Flow Cell

Utilisation générale

Document nº 15050093 v02 FRA

Consommable

Pipettes, canal unique,

20 µL

Pipettes, canal unique,

200 µL

Pipettes, canal unique,

1 000 µL

ProClin 300, 50 mL

Tubes pour microcentrifugeuse,

1,7 mL

Tween 20, liquide visqueux, 100 mL

Eau distillée

Eau de laboratoire

Eau pour PCR

Fournisseur

Fournisseur de laboratoire général

Usage mensuel

Variable

Utilisation

Utilisation générale

Fournisseur de laboratoire général

Sigma-Aldrich, référence 48912-U Variable

Tris-HCl 10 mM, pH 8,0

Tubes pour centrifugeuse,

250 mL

Tubes coniques, 15 mL

Tubes coniques, 50 mL, autoportants

Fournisseur de laboratoire général

Corning, référence 430776

Fournisseur de laboratoire général

Corning, référence 430052

Fournisseur de laboratoire général

Corning, référence 430921

Variable

Fournisseur de laboratoire général Variable

Lavage de maintenance de l’instrument

Utilisation générale

Lavage de l’instrument et lavage de maintenance mensuel

Collecte et mesure des volumes de déchets

Stockage des Flow Cells

(autre que les tubes de stockage fournis dans la trousse de réactifs)

Utilisation générale

Sigma-Aldrich, référence P7949

Fournisseur de laboratoire général

Millipore

Consultez la section

Recommandations à propos de l’eau de

laboratoire.

Fournisseur de laboratoire général

Variable

1 000 L

Variable

Utilisation générale

Lavage de maintenance de l’instrument

Utilisation générale

Lavages de l’instrument; positions vides des réactifs

Utilisation générale

Recommandations à propos de l’eau de laboratoire

Utilisez toujours de lʼeau de laboratoire pour réaliser des procédures sur l’instrument.

N’utilisez jamais d’eau courante ou d’eau désionisée. Voici des exemples d’eaux de laboratoire acceptables :

}

PW1 d’Illumina

}

Eau 18 mégohms (MΩ)

} Eau Milli-Q

}

Eau Super-Q

}

Eau de qualité biologie moléculaire

Guide d’aménagement du laboratoire et de préparation du site du système HiSeq X

Équipement de génération d’amplifiats et de séquençage

Élément

Balance, chargement par le haut, numérique, capacité de 420 g

Support pour flacons, tube pour centrifugeuse de 15 mL, recouvert de résine

époxyde

Support pour flacons, tube pour centrifugeuse de 250 mL à 6 positions, recouvert de résine époxyde

Microcentrifugeuse de paillasse

Source

Sartorius, modèle CPA423S (ou

équivalent)

Fournisseur de laboratoire général

LabScientific, référence TR-15

Fournisseur de laboratoire général

LabScientific, nº de référence CBR-200

Fournisseur de laboratoire général

Congélateur, de -15 à -25 °C

Quantité

10¹

5²

10¹

5²

2 (minimum)

5 (recommandé)¹

3 (recommandé)²

Plusieurs

Boîtes de stockage pour congélateur,

étagères

(si non inclus)

Bac à glaçons

Fournisseur de laboratoire général

Portoirs de microtubes à centrifuger

Centrifugeuse pour microplaques

Agitateur pour microplaques à grande vitesse (peut agiter à 1 800 tr/min)

• 110 V/120 V

• 230 V

Insert du bloc chauffant MIDI

Parafilm

Portoirs de tubes pour PCR

Réfrigérateur, de 2° à 8 °C

Brucelles, pointe carrée en plastique

Agitateur

Fournisseur de laboratoire général

VWR, référence 13500-890

VWR, référence 14216-214

Illumina, référence BD-60-601

Fournisseur de laboratoire général

McMaster-Carr, nº de référence 7003A22

(ou similaire)

Fournisseur de laboratoire général

1 (minimum)

2 (recommandé)

¹ HiSeq X Ten

² HiSeq X Five

Document nº 15050093 v02 FRA

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